影片《双马尾女战士》讲述了城市中接连有少女失踪，这一切的幕后黑手是邪恶组织黑山组。三个情感中存在瓜葛且社会身份各异的女孩被一个神秘人选中，拥有了各自的超能力，走上了对抗黑山组的道路。

2000年，林志强和初中好兄弟刘晓军一起升入高中，他们二人与活泼的王佳和大大咧咧的陈曦成为挚友。四个人之间的友情爱情互相纠缠，发生了各种啼笑皆非的故事，一起走过了回不去的青春时光。